Номенклатура, применяемая для обозначения таламических ядер, основывается главным образом на топографических принципах, однако, как справедливо отметил Ajmone-Marsan (1965), путаница, существующая в этом вопросе, связана с разными подходами.
При сегодняшнем уровне знаний, по-видимому, наиболее правильным будет при выборе номенклатуры ядер применение топографического подхода с учетом эмбриофилогенеза, а при определении функциональной принадлежности — оценка связей и всей совокупности наблюдаемых биоэлектрических и поведенческих реакций при воздействии на данное ядро.
В процессе эволюции в филогенетическом ряду позвоночных имели место такие морфо-физиологические трансформации целого ряда таламических ядер и других структур мозга (А. И. Карамян, 1970), в результате которой некоторые ядра почти изменили свою функциональную направленность, а некоторые вообще начали формироваться только у млекопитающих и достигли своего развития лишь у высших форм (плотоядные, приматы, антропоиды, человек), например, срединный центр — Centrum medianum (CM).
Следует упомянуть, что у всех высших животных, начиная с кошки, а также у приматов и человека в таламусе примерно одинаковое распределение ядер (А. И. Карамян, 1970). Различия касаются главным образом функциональной зрелости и некоторых топографических особенностей того или иного комплекса ядер.
В настоящее время наибольшее признание в нейрофизиологии получила функциональная классификация, согласно которой таламические ядра выделяются в три большие группы: переключающие ядра (реле), которые называют еще специфическими, ассоциативные ядра и ядра неспецифической системы (Ajmone-Marsan, 1965).
| Название ядер | Функции | Связи | Проекции |
| I. Специфическая таламо-кортикальная проекционная система (передаточные ядра — реле коры) | |||
| Вентральное задне-латеральное (VPL) | Соматические и висцеральные (чувствительность туловища и конечностей) | Медиальный лемниск, спино-таламический и спино-цервикальный тракты | Локальные к сомато-сенсорным областям коры |
| Вентральное задне-медиальное (VPM) | Те же (чувствительность лица) | Вентральный и дорсальный тригеминальные тракты | Те же |
| Передние: дорсальное (AD) вентральное (AV) медиальное (AM) | Висцеральные | Маммило-таламический тракт | К лимбической коре (поясная извилина) |
| Вентральное латеральное (VL) | Соматические и моторные | Мозжечково-таламический тракт | К моторным областям коры |
| Коленчатое тело латеральное (GL) | Зрительные | Зрительный тракт | Локальные к зрительным областям коры |
| Коленчатое тело медиальное (GM) | Слуховые | Латеральный (слуховой) лемниск | Локальные к слуховым областям коры |
| II. Ассоциативная система | |||
| Латеральное: дорсальное (LD) заднее (LP) | Соматические и висцеральные | VPL, VPM | К теменным ассоциативным областям коры |
| Подушечное (Pulv.) | Зрительные, слуховые и соматические (?) | QL, GM, VP(?), интраламинарные ядра | К зрительным, слуховым ассоциативным областям коры |
| Медиальное дорсальное (MD) | Висцеральные и соматические | LD, LP, гипоталамус, полосатое тело | К орбитальным, фронтальным и префронтальным областям коры |
| III. Неспецифическая таламо-кортикальная проекционная система (таламическая ретикулярная формация) | |||
| А. Ядра с проекцией в кору | |||
| Интраламинарная группа: срединный центр (СМ) парацентральное (Рс), центральное латеральное (СI), парафасцикулярный комплекс (Pf, Spf) | Преимущественно сомато-висцеральные и моторные | Все сенсорные тракты, особенно соматические; ретикулярная формация ствола; ядра стриопаллидарной системы и таламуса; кортикофугальные | Преимущественно к сенсомоторным II фронтальным областям коры. Отдельные проекции ко всей коре |
| Вентральное переднее (VA) субмедиальное (Sm) | Ретикулярная формация ствола, ядра стрио-паллидарной системы и таламуса, особенно СМ — Pf | Отдельные проекции ко всей коре, особенно в передние отделы | |
| Ретикулярное (R) | Ретикулярная формация ствола, ядра стрио-паллидарной системы и таламуса, особенно СМ — Pf кортикофугальные | Отдельные проекции ко всей коре | |
| Б. Ядра с подкорковой связью | |||
| Перивентрикулярное (Pv), центральное медиальное (Сm), центральная серая масса (Gc) | Преимущественно таламические ядра неспецифической системы | Не обнаружены | |
| Вентральное медиальное (VM) | Ядра стрио-паллидарного комплекса и гиппокамп | Не обнаружены | |
| Паратениальное (Pt) | Таламические ядра | К передним отделам коры | |
Такая классификация представляется удовлетворительной, так как позволяет объяснить целый ряд функциональных особенностей таламо-кортикальных взаимоотношений.